氟硼酸鉀有毒。證據表明，氟硼酸鉀在高溫下分解成有毒的三氟化硼氣體，在水蒸氣存在的情況下迅速水解，產生白煙，刺激皮膚、眼睛和肺。半數氟硼酸鉀的致死量為240mg/kg(大鼠，腹腔)，顯示出一定程度的毒性。因此，氟硼酸鉀確實有毒。